摘要:目的 通过网络药理学和分子对接技术探究湿润烧伤膏治疗放射性皮炎的作用机制。方法 从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和HERB数据库中检索湿润烧伤膏的所有成分。使用UniProt和GeneCards、OMIM、TTD数据库检索靶点对应的基因。使用Cytoscape 3.10.0构建网络图。使用STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络。使用基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析湿润烧伤膏的核心靶点。将湿润烧伤膏的主要活性成分与核心靶点进行分子对接。结果 活性成分-靶点网络主要包含98个成分和412靶点。关键靶点包括肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤蛋白53(TP53)和半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(CASP3)。生物过程(BP)主要包括程序性细胞死亡的正向调控、对外来化学物质的反应、炎症反应的调节、对伤口的反应等;细胞组分(CC)主要包括膜筏、质膜的外侧、囊泡腔室、蛋白酶抑制复合体等;分子功能(MF)主要包括转录因子结合、激酶结合、蛋白质特定区域结合、蛋白质激酶活性、泛素样蛋白连接酶结合、整合素结合、细胞因子受体结合。KEGG通路主要包括癌症中的信号通路、脂质代谢与动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)、核因子-κB(NF-κB)、FoxO转录因子、Janus激酶-信号转导和转录激活因子(JAK-STAT)等信号通路。Degree值前5位的活性成分包括槲皮素、黄芩素、棕榈酸甲酯、尿黑酸和汉黄芩素,分子对接结果显示湿润烧伤膏的活性成分与放射性皮炎核心靶点的结合活性较好。结论 湿润烧伤膏可能通过IL-6、IL-1β、TNF、TP53、CASP3等靶点,调控JAK/STAT、NF-κB、PI3K/Akt等信号通路发挥治疗放射性皮炎的作用。
摘要:目的:利用网络药理学和分子对接技术对湿润烧伤膏治疗糖尿病溃疡的主要活性成分和潜在作用机制进行探讨。方法:基于TCMSP数据库筛选湿润烧伤膏主要活性成分和作用靶点,从GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库中查找糖尿病溃疡相关靶点,使用STRING 11.5数据库构建蛋白互作(PPI)网络筛选核心靶点,在Cytoscape 3.8.2软件中制作“药物-靶点-疾病”网络图筛选核心活性成分,使用R语言软件进行基因GO功能和KEGG通路富集分析,最后应用分子对接对筛选结果进行初步验证。结果:筛选出湿润烧伤膏37个活性成分映射100个作用靶点,糖尿病溃疡疾病靶点5 527个,交集靶点77个,PPI网络拓扑分析提示TP53、TNF、HSP90AA1等为关键靶点;“药物-靶点-疾病”网络图显示刺槐素、汉黄芩素、槲皮素、吴茱萸次碱等为核心活性成分;GO功能分析主要涉及血管生成、离子转运、管径调节、细胞因子受体结合等过程,KEGG富集分析主要包括PI3K-Akt、AGE-RAGE等信号通路;分子对接显示核心活性成分和关键靶点均具有较好的对接活性。结论:湿润烧伤膏治疗糖尿病溃疡是多成分、多靶点、协同调节的结果,为湿润烧伤膏的临床应用和糖尿病溃疡治疗的研究提供一定的理论依据。
摘要:目的:1.通过网络药理学分析对湿润烧伤膏(Moist Exposed Burn Ointment,MEBO)治疗压疮进行机制研究,探讨MEBO治疗压疮潜在的分子靶点和信号通路,同时利用分子对接技术明确关键分子靶点与有效活性成分的结合稳定性。2.通过病例回顾性研究,总结MEBO在治疗压疮过程中所起的作用。方法:1.通过TCMSP数据库获取MEBO组成中药的有效化学成分及其对应靶点,再利用Uni Prot数据库将其转化为相对应的基因靶点名称(gene symbol)。通过Gene Cards、OMIM、Pharmgkb数据库,检索获取压疮相关基因并取交集。将MEBO对应靶点与Gene Cards、OMIM、Pharmgkb获得的压疮相关基因取交集,得到MEBO治疗压疮的靶点。将MEBO与压疮交集靶点导入至String数据库构建PPI网络,再利用Cytoscape 3.9.1软件中的Cyto NCA插件进行网络拓扑学分析,并基于R软件计算PPI网络中的DC、BC、CC、EC、LAC和NC平均值,基于这些平均值,筛选PPI网络中的核心靶点。运用Metascape数据库对MEBO与压疮交集靶点进行KEGG及GO富集分析,将得到的部分富集结果以气泡图形式可视化。利用Cytoscape 3.9.1软件构建“药物活性成分-作用靶点”网络图,通过计算网络中各成分的Degree值,分析MEBO治疗压疮的核心成分。然后利用CB-Dock平台对接核心成分与核心靶蛋白,预测关键活性成分与核心靶蛋白的结合活性,并对结果进行可视化。2.通过使用广西中医药大学第一附属医院的电子病历系统及临床一体化平台,收集和随访2019年12月至2021年12月入住创面修复科符合压疮诊断的患者的电子病历数据,探讨并总结该院使用MEBO治疗压疮的特点及效果。结果:1.基于TCMSP平台获取MEBO有效化学成分156个及其对应靶标基因282个,共得到1905个与压疮有关的疾病靶点。MEBO与压疮的共同靶点蛋白有182个,其中,预测MEBO治疗压疮的药物活性成分主要包括quercetin(槲皮素)、apigenin(芹菜素)、morphine(吗啡)、wogonin(汉黄芩素)、salutaridine(多花罂栗碱)、baicalein(黄芩苷)等,预测的核心靶点为TP53(细胞肿瘤抗原53)、ESR1(雌激素受体1)、MAPK3(丝裂原活化蛋白激酶3)、IL-6(...